Второе пришествие популярного аниме-сериала «Наруто».
Это аниме покроет вторую часть сюжетной линии манги, которая берёт своё начало два года спустя, после событий в конце памятной арки о попытки вернуть Саске в деревню Скрытого Листа (серии 107-135).
История вращается в основном вокруг новых приключений Узумаки Наруто, Харуно Сакуры и их поиска Учиха Саске после того как тот покинул родную деревню чтобы обрести силу у Орочимару. Сюжет также покажет большую ативность, чем прежде Акатсуки в продвижении их плана по захвату всех «хвостатых» монстров.
После неудавшейся попытки вернуть Саске, Наруто узнает, что ему осталось менее трех лет, дабы подготовиться к битве с Орочимару, которому нужно время, прежде чем переселиться в тело Саске. Наруто также должен подготовиться к схватке с Акацуки, когда те выйдут на его след. Ради тренировки Наруто покидает Селение Листвы и подвергается интенсивному обучению под руководством Джирайи. В это время, Сакура становится ученицой Цунаде, а Саске послушником Орочимару. Таким образом, все три члена Команды 7 обучаются у Легендарных Саннинов
Серия 1-2 - Возвращение домой - Акацуки начинают действовать
Серия 3 - Результаты тренировки
Серия 4 - Дзинтюрики Песка
Серия 5 - В роли Кадзэкагэ...!
Серия 6-7 - Миссия завершена! - Беги, Канкуро!
Серия 8-9 - Вмешательство команды Какаси - Слёзы Дзинтюрики
Серия 10 - Слёзы Дзинтюрики
Серия 11 - Ученица ниндзя-медика
Серия 12 - Решительность Тиё
Серия 13 - Судьбоносная встреча
Серия 14 - Зрелость Наруто
Серия 15 - Скрытое оружие называется...
Серия 16 - Секрет дзинтюрики
Серия 17 - Смерть Гаары!
Серия 18 - Вторжение! Ловушка позади входа
Серия 19 - Ловушка сработала! Противники команды Гая
Серия 20 - Хируко против двух куноити
Серия 21 - Истинное лицо Сасори
Серия 22-23 - Секретные способности Тиё. - Отец и Мать
Серия 24 - Третий Кадзэкагэ
Серия 25 - Три минуты между жизнью и смертью
Серия 26 - Десять кукол против сотни
Серия 27 - Несбывшаяся мечта
Серия 28 - Возрождённые звери
Серия 29-30 - Прозрение Какаси! - Красота мгновения!!
Серия 31 - Следующее поколение
Серия 32 - Возвращение Кадзэкагэ
Серия 33 - Новая цель!
Серия 34 - Новая команда Какаси сформирована!
Серия 35 - Нежелательное пополнение
Серия 36-37 - Ложная улыбка - Неназванный
Серия 38 - Моделирование
Серия 39 - Мост Тэнти
Серия 40-41 - Высвобождение Девятихвостого!! - Начало сверхсекретной миссии
Серия 42 - Оротимару против дзинтюрики
Серия 43 - Слёзы Сакуры
Серия 44 - Правда о борьбе
Серия 45 - Последствия предательства
Серия 46 - Незавершённая страница
Серия 47 - Проникновение! Логово ядовитого змея!
Серия 48 - Связи
Серия 49 - Нечто важное
Серия 50 - История рисованной книги
Серия 51-52 - Воссоединение - Сила Утихи
Серия 53 - Заглавие
Серия 54 - Кошмар
Серия 55 - Ветер
Серия 56 - Изгиб
Серия 57-58 - Лишённый вечного сна - Одиночество
Серия 59 - Новый враг
Серия 60 - Колесо фортуны
Серия 61 - Контакт
Серия 62 - Союзник
Серия 63 - Два короля
Серия 64-65 - Чёрный сигнальный огонь - Оковы тьмы
Серия 66 - Ожившие души
Серия 67 - Борьба со смертью
Серия 68-69 - Время пробуждения - Отчаяние
Серия 70 - Резонанс
Серия 71 - Мой друг
Серия 72 - Тихое приближение угрозы
Серия 73 - Вторжение Акацуки
Серия 74 - Под звёздным небом
Серия 75 - Молитва старого монаха
Серия 76-77 - Следующий шаг - Восходящий пик
Серия 78-79 - Решение - Пустой крик
Серия 80 - Последние слова!
Серия 81 - Печальные новости
Серия 82 - Команда № 10
Серия 83 - Захват цели!
Серия 84 - Способность Какудзу
Серия 85 - Ужасающая тайна
Серия 86-87 - Гений Сикамару - Проклиная кого-то, ты роешь сам себе могилу!
Серия 88 - Стихия Ветра: Расэнган-Сюрикен
Серия 89 - Цена силы
Серия 90 - Решение синоби
Серия 91 - Найдено логово Оротимару
Серия 92 - Схватка
Серия 93 - Соединяя сердца
Серия 94 - Дождливая ночь
Серия 95 - Два амулета
Серия 96 - Невидимый враг
Серия 97 - Лабиринт искаженных отражений
Серия 98 - Появление цели
Серия 99 - Яростный хвостатый зверь
Серия 100 - В тумане
Серия 101 - Всеобщие чувства
Серия 102 - Реорганизация!
Серия 103 - Четырёхугольный запечатывающий барьер
Серия 104 - Разрушая элемент кристалла
Серия 105 - Битва за барьер
Серия 106 - Красная камелия
Серия 107 - Странные союзники
Серия 108 - Ориентир камелии
Серия 109 - Контратака Проклятой печати
Серия 110 - Чувство вины
Серия 111 - Нарушенное обещание
Серия 112 - Место, куда можно вернуться
Серия 113 - Змеиный ученик
Серия 114 - Глаз Ястреба
Серия 115 - Великий меч Дзабудзы
Серия 116 - Страж Железной Стены
Серия 117 - Дзюго из Северного Убежища
Серия 118 - Команда!
Серия 119-120 - Какаси Гайдэн ∼ Жизнь мальчика на поле боя! Части1-2
Серия 121 - Собрание
Серия 122 - Охота
Серия 123 - Столкновение!
Серия 124 - Искусство
Серия 125 - Исчезновение
Серия 126 - Сумерки
Серия 127 - Истории об отважном ниндзя: Свиток Дзирайи~ Часть 1
Серия 128 - Истории об отважном ниндзя: Свиток Дзирайи~ Часть 2
Серия 129 - Проникновение! Деревня Скрытого Дождя!
Серия 130 - Мужчина, который стал Богом
Серия 131 - Активация! Режим Отшельника!
Серия 132 - Встреча с Шестью Путями Пэйна
Серия 133 - Сказание о храбром Дзирайе
Серия 134 - Приглашение на банкет
Серия 135 - Долгожданный момент...
Серия 136 - Свет и тьма мангэкё сярингана
Серия 137 - Аматэрасу!
Серия 138 - Конец
Серия 139 - Тайна Тоби
Серия 140 - Судьба
Серия 141 - Правда
Серия 142 - Битва в Громовом Ущелье
Серия 143 - Восьмихвостый против Саскэ
Серия 144 - Странник
Серия 145 - Хранитель запретного дзюцу
Серия 146 - Чувства хранителя
Серия 147 - Прошлое беглеца
Серия 148 - Наследница тьмы
Серия 149 - Разделение
Серия 150 - Активация запретного дзюцу
Серия 151 - Учитель и ученик
Серия 152 - Мрачные новости
Серия 153 - Следуя за тенью учителя
Серия 154 - Расшифровка
Серия 155 - Первый вызов
Серия 156 - Превосходить учителя
Серия 157 - Коноха атакована!
Серия 158 - Сила веры
Серия 159 - Пэйн против Какаси
Серия 160 - Тайна Пэйна
Серия 161 - Я - Конохамару, из клана Сарутоби
Серия 162 - Миру - боль
Серия 163 - Взрыв! Режим Отшельника!
Серия 164 - На пределе! Режима Отшельника больше нет!
Серия 165 - Захват Девятихвостого завершён
Серия 166 - Признание
Серия 167 - Тибаку Тэнсэй
Серия 168 - Четвёртый Хокагэ
Серия 169 - Два ученика
Серия 170 - Большое приключение! В поисках наследства Четвёртого Хокагэ! Часть 1
Серия 171 - Большое приключение! В поисках наследства Четвёртого Хокагэ! Часть 2
Серия 172 - Встреча
Серия 173 - Рождение Пэйна
Серия 174 - История Удзумаки Наруто